Introducción: La doble infección VIH-1/2 es un evento poco probable aún en poblaciones donde estos virus cocirculan, sin embargo una vez confirmado el diagnóstico de la misma es imprescindible caracterizar los individuos afectados. El objetivo de este trabajo fue caracterizar aspectos epidemiológicos, virológicos y moleculares de individuos confirmados como doble infectados VIH-1/2, en Cuba. Métodos: Se estudiaron dos individuos doble infectados VIH-1/2, denominados como A y B, a los cuales se les realizó un seguimiento longitudinal. Para la caracterización fenotípica y  genotípica  se utilizaron células mononucleares de sangre periférica (CMSP) y plasma de estos individuos. Se realizó el análisis de las secuencias  de los fragmentos env de VIH-2 y pol de VIH-1. Se evaluó la capacidad de replicación en CMSP de donantes sanos y línea celular MT2 con los sistemas DAVIH-AG-P24 y Lenti RT Activity. Resultados: El paciente A, con diagnóstico previo VIH-2, procedente de Sierra Leona,  resultó  asintomático; presentó una forma recombinante circulante (FRC) 02_AG  del VIH-1 y una variante  del VIH-2 no tipable. El paciente B, inicialmente diagnosticado VIH-1, de origen cubano,  había   progresado  a sida al momento del diagnóstico de  la doble infección;  presentó una FRC 20_BG del VIH-1 y grupo A del VIH-2.  Se logró el aislamiento viral a partir de CMSP en ambos pacientes, que fueron no inductores de sincicios en la línea celular MT2. Se obtuvo una concentración de 250 pg/mL en ambos sistemas de detección. Conclusiones: Se determinaron las principales características epidemiológicas, fenotípicas y genotípicas  de las variantes de VIH-1 y VIH-2 aisladas de los pacientes estudiados.